Mientras realizaba un reconocimiento, el guerrero ninja cayó en una trampa y pudo capturar al samurái. Nuestro héroe pudo salir de la jaula y ahora tendrá que escapar. Tú en el juego Ninja Escape ayudarás al ninja en esta aventura. Tu personaje será visible en la pantalla frente a ti, quien poco a poco irá ganando velocidad y corriendo por la carretera. En su camino habrá obstáculos y trampas que tu héroe deberá superar a gran velocidad. También en el camino del ninja habrá samuráis que quieren destruir a tu héroe. Tú, usando un arsenal de varias armas arrojadizas, tendrás que arrojarlas al enemigo. Cuando golpees a los enemigos, los destruirás y obtendrás una cierta cantidad de puntos por esto en el juego Ninja Escape.