Un valiente samurai llegó a una importante metrópoli estadounidense de Japón. Un grupo ninja se esconde en la ciudad y nuestro héroe tendrá que destruirlos. Tú en Roof Top Samurai lo ayudarás en esta aventura. Tu personaje subirá al techo del edificio a altas horas de la noche y comenzará a saltar hacia adelante a lo largo de las cubiertas. Tan pronto como se encuentre con el enemigo, entrará en la batalla. Si controlas sus acciones con la ayuda de la espada, tendrás que matar a todos tus oponentes. Después de su muerte, deberás recoger los trofeos que le caen al enemigo.