El héroe de píxeles en miniatura lleva a Micro Metroid en un viaje a través de un mundo de microplataforma al estilo Metrovania. Ayúdalo a pasar zonas peligrosas en las plataformas y éstas serán cada vez más numerosas. Cuidado con los engranajes y elige lugares donde puedas saltar a la plataforma y seguir adelante. Habrá banderas a lo largo del camino: estos son puntos de control que te proporcionarán un lugar al que el héroe regresará si se mete en picos o se cae de una plataforma en Micro Metroid.
