El famoso mercenario, apodado Storm, fue contratado por el gobierno estadounidense para llevar a cabo una misión secreta. Nuestro héroe tendrá que atravesar el río hasta la base militar del enemigo y destruir a varios comandantes de alto rango allí. Tú, en el juego Commando Boat, ayudarás al héroe a llevar a cabo esta tarea. Frente a ti en la pantalla verás un río por el que tu personaje correrá en su bote, ganando velocidad gradualmente. En el camino de su movimiento, surgirán varios tipos de obstáculos. Mediante las teclas de control, obligarás a la embarcación a realizar maniobras en el agua y así evitar colisiones con estos obstáculos. El río está patrullado por barcos y botes enemigos. Si te acercas a ellos tendrás que abrir fuego para matar. Al disparar con precisión, destruirá las naves enemigas y obtendrá puntos por ello. También trata de recolectar monedas de oro y otros objetos que flotan en el agua. Te darán puntos y te otorgarán varias bonificaciones útiles.
